母钟与子钟采用主从分布式控制结构，机电一体化设计：整套系统分为GPS接收系统、微电脑监控系统、母钟控制系统、子钟机芯驱动管理及实时反馈系统等部分。整套系统集成化程度高，核心控制电路采用目前较精密的SMT生产工艺，具有更好的电磁兼容性,稳定性更强，是目前较先进的塔钟控制系统。走时控制系统：微电脑控制，全自动运行,子母钟系统采用闭环控制，保持子母钟与北京时间同步运行。它通过母钟和智能机芯控制器的协调工作来完成：控制器自动扫描指针位置，自动跟踪母钟运行，向对应的步进电机发出走时信号，并由实时反馈系统发回反馈信号，及时纠正因外部因素造成的走时偏差，以保证机芯运行的准确性和可靠性。